UCL-3500紫外交聯(lián)儀用于CLIP-seq實驗
UCL-3500紫外交聯(lián)儀為一款254nm短波紫外交聯(lián)儀,內部安裝了6根15w 254nm紫外線燈管,采用了鋁合金輻照腔,輻照腔面積大,紫外線輻照均勻,滿足各種紫外線輻照實驗,是Northern, Southern,Slot或Dot印跡固膜、CLIP-seq實驗的工具。
CLIP-seq,又稱為HITS-CLIP,即紫外交聯(lián)免疫沉淀結合高通量測序(crosslinking-immunoprecipitation and high-throughput sequencing), 是一項在全基因組水平揭示RNA分子與RNA結合蛋白相互作用的革命性技術。
CLIP-seq主要原理是基于RNA分子與RNA結合蛋白在254nm紫外照射下發(fā)生耦聯(lián),以RNA結合蛋白的特異性抗體將RNA-蛋白質復合體沉淀之后,回收其中的RNA片段,經添加接頭、RT-PCR等步驟,對這些分子進行高通量測序,再經生物信息學的分析和處理、總結,挖掘出其特定規(guī)律,從而深入揭示RNA結合蛋白與RNA分子的調控作用及其對生命的意義。
CLIP-seq 紫外輻照能量設置為:
打開UCL-3500紫外交聯(lián)儀電源。
將要輻照的細胞放進紫外交聯(lián)儀的輻照腔內。
按壓程序按鍵(program)選擇能量模式(energy),能量模式綠色指示燈點亮。
通過數字按鍵按壓0.4,再按enter按鍵,0.4J/cm2能量設置完成。
按start按鍵,輻照開始,顯示屏顯示剩余能量,輻照完成后,交聯(lián)儀自動停止輻照。
取出輻照的細胞,關閉交聯(lián)儀電源。